O IBA é conduzido pelos princípios das melhores práticas de governança, com uma estrutura composta pela assembleia, conselho gestor, conselho fiscal, diretoria executiva, auditoria interna e auditoria externa.

 

Composta pelas associações de produtores de algodão dos seguintes estados: Bahia,  Goiás, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Maranhão, Minas Gerais, Paraná, Piauí e São Paulo.

 

Composto por três representantes das associações de produtores e por três representantes do Governo Federal, sendo um do Ministério da Agricultura, um do Ministério da Indústria e Comércio e um do Ministério das Relações Exteriores.

 

Composto por dois representantes das associações de produtores e um representante do Ministério das Finanças, do Governo Federal.

 

Composta pelo Presidente Executivo, diretoria administrativa e financeira e diretoria técnica.

 

O IBA publica periodicamente nesse site os relatórios da administração, seus balanços e os projetos financiados.